Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms