Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC13A1Q9BZW2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC13A1Q9BZW2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms