Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms