Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms