Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms