Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.5 ms