Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORT1Q99523 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORT1Q99523 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms