Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ASB11-202ENST00000380470 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CSPG4P10-201ENST00000456932 4817 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PCNX4-204ENST00000406949 3513 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GIMAP6-203ENST00000618759 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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