Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ULK4Q96C45 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ULK4Q96C45 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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