Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GCN1Q92616 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GCN1Q92616 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GCN1Q92616 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCN1Q92616 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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