Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATL2Q8NHH9 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms