Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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