Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q71RC1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q71RC1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q71RC1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms