Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms