Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms