Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN3Q4LDR2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms