Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP27-1Q3LI81 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP27-1Q3LI81 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms