Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms