Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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