Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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