Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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