Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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