Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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