Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms