Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD1Q15327 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD1Q15327 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms