Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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