Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEA1Q15075 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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