Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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