Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NBR1Q14596 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms