Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms