Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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