Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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