Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms