Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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