Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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