Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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