Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX1P83916 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms