Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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