Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms