Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms