Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PTPRBP23467 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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