Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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