Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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