Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM228BP0C875 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms