Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA4P06727 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms