Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT6BP04259 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6BP04259 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6BP04259 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms