Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FABP7O15540 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FABP7O15540 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FABP7O15540 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FABP7O15540 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FABP7O15540 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FABP7O15540 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms