Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DIRC3C9JPN6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms