Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms