Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms